Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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P10404 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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P10404 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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P10404 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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P10404 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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P10404 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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P10404 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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P10404 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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P10404 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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