Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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EdaO54693 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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EdaO54693 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
EdaO54693 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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EdaO54693 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
EdaO54693 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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EdaO54693 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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EdaO54693 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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EdaO54693 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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EdaO54693 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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EdaO54693 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
EdaO54693 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
EdaO54693 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms