Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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