Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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