Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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