Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm2035J3QP87 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm2035J3QP87 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm2035J3QP87 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm2035J3QP87 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm2035J3QP87 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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