Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms