Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20834J3QM72 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms