Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn34c3J3QJW5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn34c3J3QJW5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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