Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms