Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp54bE9PXC0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms