Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms