Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Zbed5B2RPU8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms