Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms