Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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