Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccr9Q9WUT7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccr9Q9WUT7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccr9Q9WUT7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms