Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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