Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rabgef1Q9JM13 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rabgef1Q9JM13 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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