Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Habp4Q9JKS5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Habp4Q9JKS5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms