Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Mrpl39Q9JKF7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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