Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms