Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim23Q9DAL0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms