Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms