Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms