Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rufy3Q9D394 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms