Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snapc3Q9D2C9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Snapc3Q9D2C9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Snapc3Q9D2C9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Snapc3Q9D2C9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Snapc3Q9D2C9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Snapc3Q9D2C9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Snapc3Q9D2C9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snapc3Q9D2C9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms