Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms