Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cxxc1Q9CWW7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms