Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms