Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms