Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed9Q99KF1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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