Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krcc1Q99JT5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms