Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Apobec3Q99J72 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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