Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Med28Q920D3 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms