Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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