Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms