Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Znf628Q8CJ78 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf628Q8CJ78 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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