Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Card11Q8CIS0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Card11Q8CIS0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Card11Q8CIS0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Card11Q8CIS0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Card11Q8CIS0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Card11Q8CIS0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms