Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vwa8Q8CC88 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vwa8Q8CC88 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms