Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp20Q8C6M1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp20Q8C6M1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms