Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Col6a6Q8C6K9 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Col6a6Q8C6K9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Col6a6Q8C6K9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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