Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx17Q8BVL3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms