Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms