Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnpy4Q8BQ47 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnpy4Q8BQ47 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnpy4Q8BQ47 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnpy4Q8BQ47 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnpy4Q8BQ47 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnpy4Q8BQ47 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms