Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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