Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms