Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim12Q78RX3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms