Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttbk1Q6PCN3 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms