Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smchd1Q6P5D8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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