Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q6DFW0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q6DFW0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms